Можно отсортировать оба массива, тогда наверное ещё проще будет.
По размерам массивов старого и нового можно понять сколько окон вылетело.
Если новое окно заводится автоматом тогда ещё проще, просто сравнивая хендлы, как в моем примере.
Цитата
скрипт заводит обратно вылетевшее окно с новым хендлом
Вот этот момент интересен. Разве этот момент ты не можешь контролировать?