Код
get mouse_pos #x #y abs // получить абсолютные координаты курсора
left 100 200 abs // клик куда надо
Move #x #y abs // вернуть курсор
Попробуй работает ли этот оператор
Код
set windowpos 0 0 1046 1026 #winwork
#winwork - рабочее окно. Если работает, то сначала чётко позиционируй окно всегда в одно и то же место (чтобы абсолютные координаты не менялись) и спокойно работай абсолютными координатами.