Кликанье мышью, клавиатурой и определение цвета не происходит в свернутом окне, в данном случае браузер chrom. Если же переключиться на новое окно, не сворачивая то, где запущен пилот, при запуске кликера окно, к которому привязан пилот выскакивает поверх всех окон, а это не требуется. Вот скрипт: